Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC19A1P41440 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms