Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDSP41222 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDSP41222 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms