Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV3P41162 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV3P41162 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETV3P41162 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV3P41162 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV3P41162 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV3P41162 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV3P41162 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV3P41162 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV3P41162 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV3P41162 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV3P41162 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV3P41162 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV3P41162 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV3P41162 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV3P41162 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV3P41162 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV3P41162 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV3P41162 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV3P41162 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV3P41162 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV3P41162 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV3P41162 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV3P41162 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV3P41162 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV3P41162 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV3P41162 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV3P41162 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms