Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHAP40939 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHAP40939 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHAP40939 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHAP40939 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHAP40939 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHAP40939 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHAP40939 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHAP40939 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHAP40939 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHAP40939 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHAP40939 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHAP40939 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHAP40939 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHAP40939 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHAP40939 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHAP40939 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHAP40939 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHAP40939 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHAP40939 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHAP40939 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHAP40939 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHAP40939 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHAP40939 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHAP40939 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHAP40939 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HADHAP40939 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HADHAP40939 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HADHAP40939 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HADHAP40939 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHAP40939 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHAP40939 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHAP40939 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHAP40939 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms