Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTRLP40313 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTRLP40313 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTRLP40313 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTRLP40313 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTRLP40313 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTRLP40313 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTRLP40313 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms