Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 CUS2YNL286W 858 nt4.21□□□□□ -1.74
DDI1P40087 NUG1YER006W 1563 nt4.21□□□□□ -1.74
DDI1P40087 MSC2YDR205W 2175 nt4.21□□□□□ -1.74
DDI1P40087 SEO1YAL067C 1782 nt4.2□□□□□ -1.74
DDI1P40087 RPS11AYDR025W 471 nt4.2□□□□□ -1.74
DDI1P40087 ARC1YGL105W 1131 nt4.2□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt4.2□□□□□ -1.74
DDI1P40087 SSO1YPL232W 873 nt4.2□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YCL041CYCL041C 495 nt4.2□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YPK9YOR291W 4419 nt4.2□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YSH1YLR277C 2340 nt4.2□□□□□ -1.74
DDI1P40087 ARH1YDR376W 1482 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 CPR4YCR069W 957 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 ARG82YDR173C 1068 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 SNA2YDR525W-A 240 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YER134CYER134C 537 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 GRE3YHR104W 984 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 PHA2YNL316C 1005 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 TIP41YPR040W 1071 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 STB2YMR053C 2553 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 MTC1YJL123C 1437 nt4.19□□□□□ -1.74
DDI1P40087 SWC3YAL011W 1878 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 VHS3YOR054C 2025 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 HOYDL227C 1761 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 HUL4YJR036C 2679 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 UBC1YDR177W 648 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 MHO1YJR008W 1017 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 BUD28YLR062C 378 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 SER1YOR184W 1188 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 ALG5YPL227C 1005 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 ECM32YER176W 3366 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 TRE1YPL176C 2352 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 NNK1YKL171W 2787 nt4.18□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YCR023CYCR023C 1836 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YGR269WYGR269W 327 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YNG2YHR090C 849 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 MRM1YOR201C 1239 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YOR289WYOR289W 756 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YPL025CYPL025C 558 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 SRB6YBR253W 366 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 SER33YIL074C 1410 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YLR152CYLR152C 1731 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 ORC6YHR118C 1308 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 GPI18YBR004C 1302 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 EKI1YDR147W 1605 nt4.17□□□□□ -1.74
DDI1P40087 HIS4YCL030C 2400 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 SNF2YOR290C 5112 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 SMF1YOL122C 1728 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 COQ4YDR204W 1008 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 LNP1YHR192W 837 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 CSM2YIL132C 642 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YAR030CYAR030C 342 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 APS1YLR170C 471 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 ATP14YLR295C 375 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 CKB2YOR039W 777 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YPL014WYPL014W 1146 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 PMC1YGL006W 3522 nt4.16□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YAP1802YGR241C 1707 nt4.15□□□□□ -1.74
DDI1P40087 HOS3YPL116W 2094 nt4.15□□□□□ -1.74
DDI1P40087 PEX30YLR324W 1572 nt4.15□□□□□ -1.74
DDI1P40087 KIN28YDL108W 921 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YGR066CYGR066C 879 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 BIO2YGR286C 1128 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 LSO1YJR005C-A 282 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 SPC42YKL042W 1092 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YLR036CYLR036C 612 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 RPS0BYLR048W 759 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 UIP3YAR027W 708 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 BBP1YPL255W 1158 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YDR132CYDR132C 1488 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 TDA11YHR159W 1515 nt4.15□□□□□ -1.75
DDI1P40087 IMD2YHR216W 1572 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 MDM30YLR368W 1797 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YDR056CYDR056C 618 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 COS4YFL062W 1140 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 COA3YJL062W-A 258 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 PRM10YJL108C 1152 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 COS3YML132W 1140 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 PRE7YBL041W 726 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YNL217WYNL217W 981 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 SUA7YPR086W 1038 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 COS2YBR302C 1140 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 PDR5YOR153W 4536 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 SAS10YDL153C 1833 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 PIM1YBL022C 3402 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 VID28YIL017C 2766 nt4.14□□□□□ -1.75
DDI1P40087 TEL1YBL088C 8364 nt4.13□□□□□ -1.75
DDI1P40087 SBE2YDR351W 2595 nt4.13□□□□□ -1.75
DDI1P40087 SVF1YDR346C 1446 nt4.13□□□□□ -1.75
DDI1P40087 GAS4YOL132W 1416 nt4.13□□□□□ -1.75
DDI1P40087 CBF5YLR175W 1452 nt4.13□□□□□ -1.75
DDI1P40087 MEF2YJL102W 2460 nt4.13□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YDL183CYDL183C 963 nt4.13□□□□□ -1.75
DDI1P40087 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.13□□□□□ -1.75
DDI1P40087 ARG8YOL140W 1272 nt4.13□□□□□ -1.75
DDI1P40087 ULS1YOR191W 4860 nt4.12□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YDR274CYDR274C 372 nt4.12□□□□□ -1.75
DDI1P40087 PCL6YER059W 1263 nt4.12□□□□□ -1.75
DDI1P40087 BUD13YGL174W 801 nt4.12□□□□□ -1.75
DDI1P40087 NMD4YLR363C 657 nt4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9 ms