Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 PIN2YOR104W 849 nt5.75□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YOR111WYOR111W 699 nt5.75□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 RDL2YOR286W 450 nt5.75□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 HSP33YOR391C 714 nt5.75□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 HSP32YPL280W 714 nt5.75□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 RPS9BYBR189W 588 nt5.75□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 RRP7YCL031C 894 nt5.75□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 IBA57YJR122W 1494 nt5.75□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 WHI2YOR043W 1461 nt5.75□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 RPT2YDL007W 1314 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 TAF8YML114C 1533 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 snR82snR82 268 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 RPN11YFR004W 921 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YGL072CYGL072C 360 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 EMC4YGL231C 573 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YGR026WYGR026W 837 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YGR226CYGR226C 210 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 BCY1YIL033C 1251 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 RPS0BYLR048W 759 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SFH1YLR321C 1281 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 GMC2YLR445W 567 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YMR085WYMR085W 1299 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SEC17YBL050W 879 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YPL199CYPL199C 723 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 KKQ8YKL168C 2175 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YLL067CYLL067C 3618 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YMR279CYMR279C 1623 nt5.74□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YCR108CYCR108C 192 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YDL016CYDL016C 303 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 MDH1YKL085W 1005 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YKL153WYKL153W 510 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 URA1YKL216W 945 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 MRPS12YNR036C 462 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 AIM39YOL053W 1188 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 MDY2YOL111C 639 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 snR11snR11 258 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 YCL007CYCL007C 393 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 THI22YPR121W 1719 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 PRT1YOR361C 2292 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 FRS2YFL022C 1512 nt5.73□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 COS9YKL219W 1224 nt5.72□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 PNG1YPL096W 1092 nt5.72□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 USV1YPL230W 1176 nt5.72□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SCD6YPR129W 1050 nt5.72□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.72□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 RXT2YBR095C 1293 nt5.72□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 snR3snR3 194 nt5.72□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 SDA1YGR245C 2304 nt5.72□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 TOS4YLR183C 1470 nt5.71□□□□□ -1.49
YAR028WP39548 VMS1YDR049W 1899 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 YIL067CYIL067C 2037 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 RDI1YDL135C 609 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 PET100YDR079W 336 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 MEI4YER044C-A 1227 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 YGL117WYGL117W 798 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 FOL2YGR267C 732 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 SYN8YAL014C 768 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 SER1YOR184W 1188 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 GAL7YBR018C 1101 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 YOR238WYOR238W 912 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 HNT3YOR258W 654 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 KEX2YNL238W 2445 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 DDC1YPL194W 1839 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 HST3YOR025W 1344 nt5.71□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 YFL040WYFL040W 1623 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 XBP1YIL101C 1944 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 HMLALPHA2YCL067C 633 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 MATALPHA2YCR039C 633 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 SDH4YDR178W 546 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 SPT15YER148W 723 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 DAM1YGR113W 1032 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 PEX21YGR239C 867 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 YAL069WYAL069W 315 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 CMS1YLR003C 876 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 RPL10YLR075W 666 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 SHE1YBL031W 1017 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 TMA16YOR252W 537 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 GRE1YPL223C 507 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 CLB1YGR108W 1416 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 HXK2YGL253W 1461 nt5.7□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 PTK2YJR059W 2457 nt5.69□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 MHF2YDL160C-A 243 nt5.69□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 OPI7YDR360W 435 nt5.69□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 YEL010WYEL010W 351 nt5.69□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt5.69□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 TYS1YGR185C 1185 nt5.69□□□□□ -1.5
YAR028WP39548 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.69□□□□□ -1.5
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