Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL3P39023 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL3P39023 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL3P39023 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL3P39023 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL3P39023 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL3P39023 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPL3P39023 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL3P39023 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL3P39023 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL3P39023 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL3P39023 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL3P39023 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL3P39023 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL3P39023 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL3P39023 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL3P39023 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL3P39023 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL3P39023 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL3P39023 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL3P39023 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms