Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZEB1P37275 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms