Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1BP36896 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms