Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms