Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 CANT1-210ENST00000591732 578 ntTSL 421.85■■□□□ 1.094e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.075e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.034e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CLN6-212ENST00000636020 894 ntTSL 221.39■■□□□ 1.014e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.974e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CLN6-205ENST00000564846 1762 ntTSL 221.1■□□□□ 0.974e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 POFUT2-209ENST00000476653 598 ntTSL 220.91■□□□□ 0.944e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 MAEA-215ENST00000512289 2426 ntTSL 220.85■□□□□ 0.934e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.934e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-212ENST00000591811 466 ntTSL 220.71■□□□□ 0.914e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.894e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.834e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.834e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.744e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FAM20B-202ENST00000440702 603 ntTSL 319.54■□□□□ 0.724e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-205ENST00000588075 881 ntTSL 219.39■□□□□ 0.694e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FCGRT-218ENST00000600273 582 ntTSL 219.35■□□□□ 0.694e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-209ENST00000551800 773 ntTSL 519.34■□□□□ 0.694e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.674e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.664e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 DCAF15-206ENST00000591802 506 ntTSL 319.12■□□□□ 0.653e-8■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-210ENST00000551888 636 ntTSL 219.09■□□□□ 0.654e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.624e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-207ENST00000550419 919 ntTSL 318.88■□□□□ 0.614e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.614e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.64e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FCGRT-214ENST00000598927 1616 ntTSL 518.82■□□□□ 0.64e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-208ENST00000551706 984 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.64e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FCGRT-209ENST00000596147 383 ntTSL 318.7■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.564e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 518.28■□□□□ 0.524e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.515e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.54e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-204ENST00000547281 825 ntTSL 318.16■□□□□ 0.54e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-215ENST00000592887 555 ntTSL 417.99■□□□□ 0.474e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-215ENST00000553237 952 ntTSL 217.79■□□□□ 0.444e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.444e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RPS7-208ENST00000481006 5429 ntTSL 1 (best)17.34■□□□□ 0.374e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FCGRT-216ENST00000599701 579 ntTSL 217.31■□□□□ 0.364e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.354e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RPS7-207ENST00000479123 511 ntTSL 1 (best)17.16■□□□□ 0.344e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CLN6-216ENST00000636876 655 ntTSL 517.06■□□□□ 0.324e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.274e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.275e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 PARD6G-AS1-201ENST00000585422 525 ntTSL 416.47■□□□□ 0.234e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 PARD6G-AS1-203ENST00000587254 584 ntTSL 416.47■□□□□ 0.234e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 POFUT2-212ENST00000493811 577 ntTSL 316.46■□□□□ 0.234e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FCGRT-207ENST00000595677 714 ntTSL 516.38■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FCGRT-213ENST00000598491 578 ntTSL 516.28■□□□□ 0.24e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-209ENST00000591625 599 ntTSL 416.23■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 GNB2-210ENST00000451587 887 ntTSL 516.21■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 POFUT2-211ENST00000493524 890 ntTSL 516.04■□□□□ 0.164e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 AC068888.1-204ENST00000550601 711 ntTSL 315.93■□□□□ 0.144e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-214ENST00000592228 1546 ntTSL 515.87■□□□□ 0.134e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SNAP47-207ENST00000475930 792 ntTSL 315.65■□□□□ 0.15e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 POFUT2-207ENST00000468360 757 ntTSL 514.81□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-208ENST00000590370 614 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 POFUT2-202ENST00000334538 3077 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-203ENST00000546489 776 ntTSL 514.1□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-212ENST00000552388 694 ntTSL 314.1□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SEC62-203ENST00000461933 363 ntTSL 214.08□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.06□□□□□ -0.165e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-214ENST00000552862 447 ntTSL 313.98□□□□□ -0.174e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.194e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.285e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-201ENST00000302345 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.314e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 BRSK1-208ENST00000592539 545 ntTSL 512.93□□□□□ -0.344e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 PARD6G-AS1-202ENST00000586421 3333 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-207ENST00000588611 900 ntTSL 312.54□□□□□ -0.44e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RPS7-203ENST00000406376 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.554e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SNAP47-211ENST00000491439 734 ntTSL 311.39□□□□□ -0.595e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 AC068888.1-205ENST00000607643 662 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.614e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CDK4-211ENST00000552254 769 ntTSL 210.09□□□□□ -0.794e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.854e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.864e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 AC068888.1-202ENST00000552905 523 ntTSL 29.08□□□□□ -0.964e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 AC068888.1-206ENST00000546767 364 ntTSL 38.94□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SEC62-208ENST00000481435 627 ntTSL 28.87□□□□□ -0.994e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SEC62-204ENST00000469515 785 ntTSL 38.5□□□□□ -1.054e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.244e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.254e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.314e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.374e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SEC62-202ENST00000460513 641 ntTSL 56.18□□□□□ -1.424e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SEC62-209ENST00000487736 508 ntTSL 54.07□□□□□ -1.764e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 ITPA-210ENST00000609835 924 ntTSL 1 (best)23.69■■□□□ 1.381e-8■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 ITPA-204ENST00000460550 967 ntTSL 218.59■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 ITPA-208ENST00000483354 1028 ntTSL 318.23■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 ITPA-209ENST00000490838 977 ntTSL 217.89■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 37.3
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 95 ms