Protein–RNA interactions for Protein: P35177

SPT7, Transcriptional activator SPT7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT7P35177 GCR2YNL199C 1605 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT7P35177 MSE1YOL033W 1611 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT7P35177 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.77□□□□□ -1.49
SPT7P35177 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.77□□□□□ -1.49
SPT7P35177 NTR2YKR022C 969 nt5.77□□□□□ -1.49
SPT7P35177 YAR030CYAR030C 342 nt5.77□□□□□ -1.49
SPT7P35177 XKS1YGR194C 1803 nt5.77□□□□□ -1.49
SPT7P35177 HOT1YMR172W 2160 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT7P35177 KRE28YDR532C 1158 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT7P35177 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT7P35177 MTF1YMR228W 1026 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT7P35177 ICY2YPL250C 411 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT7P35177 PRT1YOR361C 2292 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT7P35177 RCR2YDR003W 633 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT7P35177 YIL165CYIL165C 360 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT7P35177 RFC2YJR068W 1062 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT7P35177 YPL113CYPL113C 1191 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT7P35177 YIL001WYIL001W 1542 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT7P35177 KIC1YHR102W 3243 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT7P35177 MEC3YLR288C 1425 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT7P35177 MET12YPL023C 1974 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT7P35177 YFT2YDR319C 825 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 UBC8YEL012W 657 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 BUD16YEL029C 939 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 GSY1YFR015C 2127 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 MTM1YGR257C 1101 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 MPH2YDL247W 1830 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 ATG26YLR189C 3597 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 ATR1YML116W 1629 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 DNF2YDR093W 4839 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 GDE1YPL110C 3672 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 LCB2YDR062W 1686 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 EAF5YEL018W 840 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 SEC72YLR292C 582 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 RPL15BYMR121C 615 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT7P35177 VBA2YBR293W 1425 nt5.73□□□□□ -1.49
SPT7P35177 ESF1YDR365C 1887 nt5.73□□□□□ -1.49
SPT7P35177 PIC2YER053C 903 nt5.73□□□□□ -1.49
SPT7P35177 GMH1YKR030W 822 nt5.73□□□□□ -1.49
SPT7P35177 PRP40YKL012W 1752 nt5.72□□□□□ -1.49
SPT7P35177 MNN4YKL201C 3537 nt5.72□□□□□ -1.49
SPT7P35177 GLC3YEL011W 2115 nt5.72□□□□□ -1.49
SPT7P35177 CDC15YAR019C 2925 nt5.72□□□□□ -1.49
SPT7P35177 snR7-LsnR7-L 214 nt5.72□□□□□ -1.49
SPT7P35177 RTT103YDR289C 1230 nt5.72□□□□□ -1.49
SPT7P35177 ECM1YAL059W 639 nt5.72□□□□□ -1.49
SPT7P35177 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt5.72□□□□□ -1.49
SPT7P35177 TIF4632YGL049C 2745 nt5.71□□□□□ -1.5
SPT7P35177 KCC4YCL024W 3114 nt5.71□□□□□ -1.5
SPT7P35177 TOG1YER184C 2385 nt5.71□□□□□ -1.5
SPT7P35177 HST4YDR191W 1113 nt5.71□□□□□ -1.5
SPT7P35177 FRE7YOL152W 1863 nt5.71□□□□□ -1.5
SPT7P35177 RIA1YNL163C 3333 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 MBP1YDL056W 2502 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 FKH2YNL068C 2589 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 THI13YDL244W 1023 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 THI11YJR156C 1023 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 CDC42YLR229C 576 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 SNF8YPL002C 702 nt5.7□□□□□ -1.5
SPT7P35177 FZO1YBR179C 2568 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 FLO8YER109C 2400 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 JHD2YJR119C 2187 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 HRK1YOR267C 2280 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 NKP2YLR315W 462 nt5.69□□□□□ -1.5
SPT7P35177 STE12YHR084W 2067 nt5.68□□□□□ -1.5
SPT7P35177 DPB4YDR121W 591 nt5.68□□□□□ -1.5
SPT7P35177 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.68□□□□□ -1.5
SPT7P35177 GLE2YER107C 1098 nt5.68□□□□□ -1.5
SPT7P35177 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.68□□□□□ -1.5
SPT7P35177 RAD27YKL113C 1149 nt5.68□□□□□ -1.5
SPT7P35177 RER1YCL001W 567 nt5.68□□□□□ -1.5
SPT7P35177 SIS2YKR072C 1689 nt5.68□□□□□ -1.5
SPT7P35177 PMC1YGL006W 3522 nt5.67□□□□□ -1.5
SPT7P35177 PRP28YDR243C 1767 nt5.67□□□□□ -1.5
SPT7P35177 YJL218WYJL218W 591 nt5.67□□□□□ -1.5
SPT7P35177 PBN1YCL052C 1251 nt5.67□□□□□ -1.5
SPT7P35177 EMP47YFL048C 1338 nt5.67□□□□□ -1.5
SPT7P35177 STR2YJR130C 1920 nt5.66□□□□□ -1.5
SPT7P35177 RPS4BYHR203C 786 nt5.66□□□□□ -1.5
SPT7P35177 RPS4AYJR145C 786 nt5.66□□□□□ -1.5
SPT7P35177 YLR407WYLR407W 687 nt5.66□□□□□ -1.5
SPT7P35177 MAC1YMR021C 1254 nt5.66□□□□□ -1.5
SPT7P35177 YPL025CYPL025C 558 nt5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.9 ms