Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL1P33121 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSL1P33121 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms