Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA13P31271 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms