Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA7P31268 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms