Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDI1P31150 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDI1P31150 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDI1P31150 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDI1P31150 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDI1P31150 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDI1P31150 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDI1P31150 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDI1P31150 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI1P31150 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI1P31150 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI1P31150 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms