Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2BP30876 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2BP30876 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms