Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC27P30260 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC27P30260 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC27P30260 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC27P30260 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC27P30260 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC27P30260 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC27P30260 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC27P30260 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC27P30260 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC27P30260 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC27P30260 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC27P30260 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC27P30260 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC27P30260 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC27P30260 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC27P30260 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC27P30260 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC27P30260 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC27P30260 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC27P30260 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC27P30260 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC27P30260 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC27P30260 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC27P30260 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC27P30260 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC27P30260 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC27P30260 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC27P30260 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC27P30260 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC27P30260 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC27P30260 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC27P30260 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC27P30260 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC27P30260 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC27P30260 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC27P30260 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC27P30260 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC27P30260 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC27P30260 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC27P30260 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC27P30260 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC27P30260 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC27P30260 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC27P30260 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC27P30260 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC27P30260 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC27P30260 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms