Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARID4AP29374 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID4AP29374 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms