Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HTR1EP28566 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms