Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR2P28476 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR2P28476 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms