Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX2P28328 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX2P28328 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX2P28328 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX2P28328 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX2P28328 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX2P28328 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX2P28328 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX2P28328 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PEX2P28328 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PEX2P28328 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PEX2P28328 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX2P28328 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX2P28328 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX2P28328 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX2P28328 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX2P28328 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms