Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD1P28289 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD1P28289 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD1P28289 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD1P28289 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD1P28289 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD1P28289 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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