Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHMLP26374 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMLP26374 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMLP26374 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMLP26374 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMLP26374 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMLP26374 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMLP26374 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMLP26374 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMLP26374 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMLP26374 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMLP26374 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMLP26374 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMLP26374 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMLP26374 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMLP26374 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMLP26374 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMLP26374 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMLP26374 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMLP26374 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMLP26374 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMLP26374 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMLP26374 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMLP26374 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMLP26374 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMLP26374 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMLP26374 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMLP26374 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMLP26374 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMLP26374 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMLP26374 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMLP26374 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMLP26374 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMLP26374 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMLP26374 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMLP26374 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMLP26374 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMLP26374 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMLP26374 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMLP26374 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMLP26374 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMLP26374 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMLP26374 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMLP26374 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMLP26374 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMLP26374 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMLP26374 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMLP26374 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMLP26374 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMLP26374 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMLP26374 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMLP26374 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMLP26374 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMLP26374 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMLP26374 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMLP26374 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMLP26374 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMLP26374 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMLP26374 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms