Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YY1P25490 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YY1P25490 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YY1P25490 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
YY1P25490 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YY1P25490 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YY1P25490 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YY1P25490 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YY1P25490 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YY1P25490 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YY1P25490 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YY1P25490 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YY1P25490 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YY1P25490 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YY1P25490 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
YY1P25490 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YY1P25490 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YY1P25490 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
YY1P25490 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YY1P25490 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
YY1P25490 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YY1P25490 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YY1P25490 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
YY1P25490 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YY1P25490 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YY1P25490 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YY1P25490 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YY1P25490 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YY1P25490 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YY1P25490 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YY1P25490 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
YY1P25490 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YY1P25490 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
YY1P25490 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YY1P25490 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
YY1P25490 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YY1P25490 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
YY1P25490 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YY1P25490 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YY1P25490 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
YY1P25490 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YY1P25490 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
YY1P25490 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YY1P25490 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YY1P25490 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YY1P25490 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
YY1P25490 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YY1P25490 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YY1P25490 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
YY1P25490 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YY1P25490 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YY1P25490 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YY1P25490 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YY1P25490 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YY1P25490 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YY1P25490 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YY1P25490 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YY1P25490 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YY1P25490 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YY1P25490 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
YY1P25490 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YY1P25490 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
YY1P25490 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
YY1P25490 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YY1P25490 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YY1P25490 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YY1P25490 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms