Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms