Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MATN1P21941 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MATN1P21941 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MATN1P21941 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MATN1P21941 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MATN1P21941 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MATN1P21941 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MATN1P21941 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MATN1P21941 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MATN1P21941 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MATN1P21941 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MATN1P21941 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MATN1P21941 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MATN1P21941 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MATN1P21941 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MATN1P21941 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MATN1P21941 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MATN1P21941 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MATN1P21941 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MATN1P21941 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MATN1P21941 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MATN1P21941 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MATN1P21941 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MATN1P21941 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MATN1P21941 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MATN1P21941 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MATN1P21941 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MATN1P21941 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MATN1P21941 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MATN1P21941 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MATN1P21941 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MATN1P21941 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MATN1P21941 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms