Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB4P21439 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms