Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACO1P21399 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACO1P21399 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACO1P21399 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACO1P21399 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACO1P21399 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACO1P21399 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACO1P21399 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACO1P21399 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACO1P21399 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACO1P21399 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACO1P21399 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACO1P21399 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACO1P21399 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACO1P21399 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACO1P21399 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACO1P21399 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACO1P21399 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACO1P21399 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACO1P21399 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACO1P21399 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACO1P21399 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACO1P21399 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACO1P21399 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACO1P21399 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACO1P21399 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACO1P21399 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACO1P21399 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACO1P21399 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACO1P21399 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACO1P21399 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACO1P21399 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACO1P21399 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACO1P21399 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACO1P21399 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACO1P21399 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms