Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRHP20396 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRHP20396 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRHP20396 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
TRHP20396 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRHP20396 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRHP20396 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRHP20396 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRHP20396 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRHP20396 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRHP20396 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRHP20396 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRHP20396 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRHP20396 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRHP20396 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRHP20396 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRHP20396 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRHP20396 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRHP20396 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRHP20396 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRHP20396 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRHP20396 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRHP20396 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRHP20396 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRHP20396 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRHP20396 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRHP20396 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRHP20396 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TRHP20396 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRHP20396 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRHP20396 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRHP20396 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRHP20396 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRHP20396 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRHP20396 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRHP20396 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRHP20396 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRHP20396 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRHP20396 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRHP20396 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRHP20396 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRHP20396 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TRHP20396 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRHP20396 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRHP20396 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRHP20396 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRHP20396 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRHP20396 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRHP20396 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRHP20396 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRHP20396 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRHP20396 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRHP20396 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRHP20396 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRHP20396 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRHP20396 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRHP20396 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRHP20396 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRHP20396 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRHP20396 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRHP20396 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRHP20396 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRHP20396 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
TRHP20396 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TRHP20396 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TRHP20396 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
TRHP20396 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRHP20396 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRHP20396 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRHP20396 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRHP20396 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TRHP20396 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TRHP20396 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRHP20396 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRHP20396 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRHP20396 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRHP20396 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRHP20396 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TRHP20396 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRHP20396 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRHP20396 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRHP20396 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRHP20396 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRHP20396 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRHP20396 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRHP20396 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRHP20396 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms