Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms