Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFE3P19532 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFE3P19532 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFE3P19532 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFE3P19532 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFE3P19532 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFE3P19532 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFE3P19532 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFE3P19532 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFE3P19532 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFE3P19532 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFE3P19532 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFE3P19532 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFE3P19532 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFE3P19532 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFE3P19532 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFE3P19532 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFE3P19532 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFE3P19532 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFE3P19532 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFE3P19532 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFE3P19532 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFE3P19532 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFE3P19532 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TFE3P19532 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFE3P19532 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms