Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM21P19474 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms