Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2CP19387 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms