Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPI1P17947 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPI1P17947 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPI1P17947 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPI1P17947 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPI1P17947 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPI1P17947 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPI1P17947 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPI1P17947 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPI1P17947 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPI1P17947 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPI1P17947 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPI1P17947 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPI1P17947 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPI1P17947 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPI1P17947 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPI1P17947 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPI1P17947 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPI1P17947 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPI1P17947 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPI1P17947 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPI1P17947 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPI1P17947 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPI1P17947 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPI1P17947 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPI1P17947 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPI1P17947 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPI1P17947 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPI1P17947 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPI1P17947 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPI1P17947 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPI1P17947 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPI1P17947 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPI1P17947 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms