Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAP43P17677 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAP43P17677 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAP43P17677 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAP43P17677 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAP43P17677 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAP43P17677 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAP43P17677 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAP43P17677 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GAP43P17677 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAP43P17677 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAP43P17677 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAP43P17677 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAP43P17677 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAP43P17677 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GAP43P17677 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAP43P17677 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAP43P17677 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAP43P17677 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAP43P17677 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GAP43P17677 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAP43P17677 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAP43P17677 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAP43P17677 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAP43P17677 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAP43P17677 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAP43P17677 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAP43P17677 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GAP43P17677 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAP43P17677 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAP43P17677 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAP43P17677 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAP43P17677 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAP43P17677 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAP43P17677 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAP43P17677 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAP43P17677 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAP43P17677 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAP43P17677 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GAP43P17677 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAP43P17677 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAP43P17677 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAP43P17677 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAP43P17677 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAP43P17677 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAP43P17677 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAP43P17677 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAP43P17677 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAP43P17677 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GAP43P17677 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAP43P17677 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAP43P17677 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAP43P17677 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAP43P17677 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms