Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYN1P17600 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYN1P17600 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYN1P17600 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYN1P17600 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYN1P17600 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYN1P17600 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYN1P17600 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYN1P17600 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYN1P17600 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYN1P17600 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYN1P17600 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYN1P17600 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYN1P17600 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYN1P17600 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYN1P17600 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYN1P17600 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYN1P17600 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYN1P17600 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYN1P17600 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYN1P17600 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYN1P17600 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYN1P17600 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYN1P17600 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYN1P17600 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYN1P17600 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYN1P17600 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYN1P17600 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYN1P17600 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYN1P17600 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYN1P17600 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYN1P17600 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYN1P17600 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYN1P17600 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYN1P17600 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYN1P17600 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYN1P17600 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYN1P17600 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYN1P17600 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYN1P17600 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYN1P17600 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYN1P17600 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYN1P17600 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYN1P17600 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYN1P17600 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYN1P17600 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYN1P17600 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYN1P17600 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYN1P17600 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYN1P17600 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYN1P17600 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYN1P17600 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYN1P17600 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYN1P17600 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYN1P17600 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYN1P17600 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYN1P17600 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYN1P17600 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYN1P17600 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYN1P17600 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYN1P17600 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYN1P17600 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYN1P17600 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYN1P17600 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms