Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXB4P17483 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXB4P17483 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms