Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB9P17482 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms