Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms