Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD44P16070 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD44P16070 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD44P16070 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD44P16070 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD44P16070 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD44P16070 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD44P16070 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD44P16070 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD44P16070 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD44P16070 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD44P16070 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD44P16070 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD44P16070 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD44P16070 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD44P16070 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD44P16070 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD44P16070 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD44P16070 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD44P16070 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD44P16070 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD44P16070 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD44P16070 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD44P16070 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD44P16070 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD44P16070 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD44P16070 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD44P16070 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD44P16070 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD44P16070 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD44P16070 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD44P16070 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD44P16070 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD44P16070 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD44P16070 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD44P16070 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD44P16070 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD44P16070 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD44P16070 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD44P16070 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD44P16070 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD44P16070 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD44P16070 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD44P16070 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD44P16070 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD44P16070 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD44P16070 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD44P16070 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD44P16070 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD44P16070 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD44P16070 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD44P16070 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD44P16070 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD44P16070 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD44P16070 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD44P16070 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD44P16070 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD44P16070 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD44P16070 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD44P16070 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms