Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAG1P15918 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAG1P15918 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAG1P15918 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAG1P15918 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAG1P15918 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAG1P15918 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAG1P15918 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAG1P15918 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAG1P15918 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAG1P15918 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAG1P15918 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAG1P15918 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAG1P15918 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAG1P15918 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAG1P15918 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAG1P15918 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAG1P15918 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAG1P15918 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAG1P15918 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAG1P15918 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAG1P15918 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAG1P15918 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAG1P15918 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG1P15918 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAG1P15918 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAG1P15918 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAG1P15918 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAG1P15918 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAG1P15918 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAG1P15918 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAG1P15918 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAG1P15918 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAG1P15918 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAG1P15918 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAG1P15918 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAG1P15918 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAG1P15918 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAG1P15918 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAG1P15918 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAG1P15918 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAG1P15918 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAG1P15918 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAG1P15918 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAG1P15918 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAG1P15918 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAG1P15918 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAG1P15918 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAG1P15918 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms