Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD46P15529 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD46P15529 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD46P15529 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD46P15529 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD46P15529 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CD46P15529 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD46P15529 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD46P15529 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD46P15529 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD46P15529 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD46P15529 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD46P15529 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD46P15529 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD46P15529 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD46P15529 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD46P15529 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD46P15529 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD46P15529 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD46P15529 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CD46P15529 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD46P15529 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD46P15529 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD46P15529 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms