Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRAFP15056 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRAFP15056 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRAFP15056 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRAFP15056 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRAFP15056 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRAFP15056 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRAFP15056 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRAFP15056 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRAFP15056 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRAFP15056 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRAFP15056 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRAFP15056 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRAFP15056 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRAFP15056 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRAFP15056 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRAFP15056 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRAFP15056 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRAFP15056 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRAFP15056 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRAFP15056 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRAFP15056 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRAFP15056 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRAFP15056 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRAFP15056 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAFP15056 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAFP15056 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAFP15056 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAFP15056 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAFP15056 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAFP15056 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRAFP15056 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRAFP15056 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRAFP15056 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAFP15056 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms