Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DOBP13765 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms