Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT13P13646 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT13P13646 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT13P13646 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT13P13646 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT13P13646 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT13P13646 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT13P13646 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT13P13646 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT13P13646 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT13P13646 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT13P13646 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT13P13646 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT13P13646 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT13P13646 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT13P13646 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT13P13646 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT13P13646 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms