Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms