Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms