Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL6A2P12110 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms